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Mostrando postagens com o rótulo proteoma

A Descoberta Científica Mais Notável de 2021

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Segundo a revista Science, a capacidade de prever a estrutura tridimensional das proteínas usando inteligência artificial figura como a descoberta científica mais notável de 2021. Usando um algoritmo de IA (AlphaFold, da empresa britânica Deepmind), os cientistas conseguiram prever a complexa estrutura tridimensional que uma cadeia de aminoácidos adota ao se dobrar para dar origem a uma proteína funcional. O banco de dados e o sistema de inteligência artificial fornecem aos pesquisadores ferramentas poderosas para examinar a estrutura 3-D das proteínas e oferecem uma gama de dados que pode abrir caminho para descobertas futuras no campo da biologia. Segundo a revista Science , a capacidade de prever a estrutura tridimensional das proteínas usando inteligência artificial lidera este ano o ranking dos marcos científicos de 2021 . Usando um algoritmo de inteligência artificial ( AlphaFold , da empresa britânica Deepmind ), os cientistas conseguiram prever a complexa estrutura tridimensio...

Caracterização do Proteoma Sináptico do Peixe-Zebra

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Uma equipe internacional de pesquisadores apresentou a primeira caracterização das proteínas que se expressam nas conexões neuronais do peixe-zebra ( Danio rerio ), animal modelo amplamente usado no estudo do sistema nervoso e de suas enfermidades já que apresenta uma grande homologia com o cérebro humano. Conhecido no Brasil como "paulistinha", esta espécie é muito utilizada nas pesquisas de desenvolvimento de novos medicamentos orientados para o tratamento de desordens cerebrais como o autismo, a esquizofrenia e o retardo mental. Uma equipe internacional de pesquisadores apresentou a primeira caracterização das proteínas que se expressam nas conexões neuronais do peixe-zebra ( Danio rerio ), animal modelo para o estudo do cérebro humano e de suas patologias. Também conhecido no Brasil pelo nome de "paulistinha" , o peixe-zebra é um modelo animal amplamente usado no estudo do sistema nervoso e de suas enfermidades já que apresenta uma grande homologia co...

Genoma Humano É Reduzido

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Uma equipe de pesquisadores da CNIO reduziu o tamanho do genoma humano para 19 mil genes. Segundo eles, 1.700 genes não foram considerados por não codificarem nenhuma proteína Um estudo liderado por Alfonso Valencia , vice-diretor de Pesquisa Básica e chefe do Grupo de Biologia Computacional Estrutural do Centro Nacional de Pesquisa do Câncer (CNIO) , e Michael Tress, um pesquisador da equipe, atualizam a anotação numérica dos genes humanos que geram proteínas para 19 mil, 1.700 genes a menos do que o estimado nas últimas contagens, e bem abaixo dos 100 mil que foi estimado durante anos. O trabalho, publicado na revista Human Molecular Genetics , sugere também que quase todos estes genes teriam se originado antes do aparecimento dos primatas há 50 milhões de anos. "O declínio do genoma humano ". Eis como Valencia descreve as correções contínuas nas anotações numéricas do genoma humano, que resultaram no presente trabalho, o qual estima o número de genes em...

Proteoma: O Novo Desafio da Biologia

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Os cientistas acreditam que as maiores descobertas para as pesquisas médicas virão do estudo das proteínas. O estudo da estrutura tridimensional das proteínas vem ganhando espaço em várias instituições mundiais de pesquisa O conjunto de proteínas que se produzem em um momento determinado e sob determinadas condições em uma célula específica é chamada de proteoma . No caso do organismo humano, por exemplo, calcula-se que são sintetizadas cerca de 100 mil proteínas, com diferentes funções. De uma forma simplificada, o proteoma poderia ser considerado o equivalente protéico ao genoma - o conjunto de genes de qualquer ser vivo. Como o genoma humano possui um número muito menor de genes do que os cientistas imaginavam inicialmente, acredita-se que as maiores descobertas para as pesquisas médicas virão do estudo das proteínas e não propriamente dos genes. Na verdade, o que define as propriedades de qualquer ser vivo não é exclusivamente o DNA , e sim as proteínas codificadas po...

Mapeamento Tridimensional de Proteínas

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Mapeamento 3D de proteínas torna possível descoberta de novos medicamentos. Técnica revela forma das chamadas proteínas de membrana integrais que servem como alvo para metade dos remédios atuais Cientistas do Salk Institute for Biological Studies, nos Estados Unidos, desenvolveram um novo método para descobrir a estrutura tridimensional de um grupo de proteínas encontradas na superfície de células que servem como alvos para cerca de metade de todos os medicamentos atuais. A abordagem, descrita na revista Nature Methods, pode acelerar a descoberta de drogas, fornecendo aos cientistas alvos precisos para novas terapias. Conhecer a forma tridimensional exata das proteínas de membrana integrais (hIMPs) permite que os desenvolvedores de drogas compreendam os mecanismos bioquímicos precisos pelos quais os medicamentos atuais trabalham e pode permitir desenvolver novos medicamentos que têm como alvo essas proteínas. "Nossas células contêm cerca de 8 mil dessas proteí...

Fiocruz Traça Perfil de Verme Pouco Conhecido

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Pesquisadoras da Fiocruz traçaram o perfil proteômico de Angiostrongylus costaricensis, helminto causador da inflamação intestinal aguda conhecida como angiostrongilíase abdominal Um estudo desenvolvido pela Fundação Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz) conseguiu descrever o perfil proteômico de parasitas adultos de Angiostrongylus costaricensis , helminto causador de uma inflamação intestinal aguda conhecida como angiostrongilíase abdominal . Os resultados recentes representam o primeiro passo na busca de proteínas candidatas para ensaios de diagnóstico e tratamento desta infecção. A pesquisa foi publicada no Journal of Proteomics. Até o momento, poucas análises se concentraram sobre o causador da angiostrongilíase abdominal. A doença, transmitida por moluscos terrestres , como o caramujo africano , tem difícil diagnóstico já que, por possuir uma sintomatologia pouco específica, pode ser confundida com outras helmintoses . Devido à ausência de ferramentas de diagnóstico, a angiostron...

Estudo de Proteínas por Ressonância Magnética Nuclear

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Aparelho utilizado na Espectroscopia de RNM (NMR) em macromoléculas biológicas de tamanho pequeno a médio. Esta técnica de estudo altamente avançada é geralmente aplicada na  investigação estrutural de proteínas e ácidos nucleicos Instalado no campus da UFRJ (Universidade Federal do Rio de Janeiro) , o Centro Nacional de Ressonância Magnética Nuclear Jiri Jones (CNRMN) possui aparelhagem sofisticada que coloca imagens de última geração a serviço de pesquisadores de diversas áreas. Nesse local, um conjunto de equipamentos potentes permite visualizar até mesmo a estrutura atômica de proteínas mergulhadas em solução. Igualmente poderosa, uma série de microscópios (eletrônicos, confocais, multifotônico e multifotônico com sistema de espectrometria de correlação de fluorescência, para citar alguns) possibilita perceber nuances de estruturas protéicas e até rastrear uma única partícula viral no interior de uma célula viva.  Com o advento das técnicas de ressonância magnética bi...

Gene p53: O Guardião do Genoma

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Os genes supressores de tumores localizados no braço curto do cromossomo humano 17, e codificadores da fosfoproteina p53 (gene p53), estão sendo vistos hoje como a principal linha de pesquisa para a descoberta de novos tratamentos contra o câncer  A proteína p53 é codificada por um gene situado no cromossomo de número 17 , que leva o mesmo nome (gene p53) , em razão de seu peso molecular de 53 Kd . E se atualmente existe um gene com vocação para estrela, ele é o p53 , supressor de tumores , que já foi eleito como a molécula do ano em 2010. Em 1993, foi capa das principais revistas americanas e é conhecido como "o guardião do genoma" . Desde a sua descoberta há 30 anos, foi objeto de cerca de 50 mil trabalhos científicos (os chamados papers ). Tanto interesse num único gene se explica. O p53 aparece mutado, com perda de sua função protetora em 50% dos casos de câncer e há quem diga que nos outros 50% ele simplesmente desaparece. " O p53 funciona como um freio de eme...

Tecnologia no Estudo do Proteoma Humano

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Após o sequenciamento do genoma humano, laboratórios de todo o mundo têm se dedicado à tarefa de identificar as proteínas expressas por nossos genes em diferentes circunstâncias. O estudo do proteoma humano , como é chamado pelos pesquisadores, tem no espectrômetro de massas um de seus grandes aliados. Esse equipamento é capaz de fragmentar proteínas e identificar sua composição. Identificar as milhares de proteínas presentes em misturas complexas como fluidos biológicos é um grande desafio para os pesquisadores. Até o momento, o espectrômetro de massas do tipo orbitrap, usado nessa operação, só era capaz de analisar um fragmento de proteína por vez. Agora, uma nova metodologia desenvolvida por pesquisadores brasileiros permite que mais de um fragmento proteico seja analisado simultaneamente, o que aumenta a eficácia desse procedimento. O novo método foi apresentado em um artigo publicado no início do ano no periódico Bioinformatics. O método foi desenvolvido pelo engenheiro de computa...