Biorritmo

Após duas décadas utilizando um genoma humano de referência linear, baseado em um número limitado de indivíduos, os cientistas apresentaram recentemente o rascunho de uma coleção mais abrangente de sequências genômicas que representa de forma mais precisa a diversidade humana. Essa nova versão, chamada de pangenoma, reúne material genético de 47 pessoas de diferentes partes do mundo. Diferente do genoma humano de referência, que é linear, o gráfico do pangenoma tem muitas rotas possíveis que uma sequência pode seguir (indicadas com cores diferentes e seu tipo de variante). O primeiro pangenoma foi apresentado em uma série de artigos científicos, publicada na revista Nature pelo Consórcio de Referência do Pangenoma Humano (HPRC, na sigla em inglês) Após duas décadas utilizando um genoma humano de referência linear, baseado em um número limitado de indivíduos, os cientistas apresentaram recentemente o rascunho de uma coleção mais abrangente de sequências genômicas que representa de for...

Os primórdios da bioinformática se deu há mais de 50 anos, quando os computadores desktop ainda eram uma hipótese e nem se sonhava em sequenciar o DNA . O COMPROTEIN, foi o primeiro software de bioinformática, desenvolvido por Margareth Dayhoff (1925-1983) e Robert Ledley . O programa rodava num mainframe IBM 7090 e usava um cartão perfurado contendo uma linha de código FORTRAN (o idioma com o qual COMPROTEIN foi escrito). Na figura( C ) vemos o código-fonte de um programa inteiro escrito em cartões perfurados (Fonte: Gauthier et al., 2019) Estudantes e pesquisadores de hoje acreditam piamente que a bioinformática moderna surgiu recentemente para auxiliar a análise de dados de sequenciamento de última geração (mais conhecido pela sigla NGS ). No entanto, poucos sabem que os primórdios da bioinformática se deu há mais de 50 anos, quando os computadores desktop ainda eram uma hipótese e nem se sonhava em sequenciar  o DNA. Para se ter uma ideia, as bases da bioinformática foram lan...

GridION - Sequenciador de RNA e DNA em tempo real Tubos De Microtitulação Em Pp, Não Estéril, Volume 1,2Ml - Pct/1000Un O minION é um dispositivo de sequenciamento portátil de DNA e RNA capaz de fornecer dados em tempo real a nível de gigabases. Com o MinION você pode sequenciar qualquer coisa em qualquer lugar. Ele cabe no bolso e pode ser recarregado por USB. O aparelho MinION Mk, com um peso de 100 gramas, é do tamanho de um grampeador, o que é minúsculo comparado a outros equipamentos sequenciadores que ocupam uma mesa inteira ou que são do tamanho de uma geladeira.  O minION é um poderoso dispositivo de sequenciamento portátil de DNA e RNA , desenvolvido pela Oxford Nanopore Technology (ONT) , capaz de fornecer dados em tempo real a nível de gigabases. Com o MinION você pode sequenciar qualquer coisa em qualquer lugar. Ele cabe no bolso e pode ser recarregado por USB . O aparelho MinION Mk, com um peso de 100 gramas, é do tamanho de um grampeador, o que é minúsculo comparado...

Uma equipe internacional de pesquisadores conseguiu construir uma enorme árvore genealógica mostrando os principais acontecimentos da história da humanidade, bem como a sua cronologia e a localização geográfica. Combinando milhares de genomas antigos e modernos, eles conseguiram deduzir uma genealogia humana completa, a partir da aplicação de um novo método não paramétrico. Ao considerar todos os nossos ancestrais como uma única rede, os cientistas foram capazes de estimar características gerais de ancestrais comuns na árvore genealógica humana, como a sua idade e a sua potencial localização.  Cientistas de várias instituições científicas internacionais conseguiram construir uma enorme árvore genealógica mostrando os principais acontecimentos da história da humanidade, bem como a sua cronologia e a localização geográfica. Combinando milhares de genomas antigos e modernos, os pesquisadores conseguiram deduzir uma genealogia humana completa , a partir da aplicação de um nov...

Graças a uma nova técnica de genética forense  foi possível confirmar pela primeira vez a relação familiar entre um descendente do chefe sioux Toro Sentado.  Um trabalho científico publicado essa semana na Science Advances comparou o DNA extraído de uma mecha de cabelo do líder indígena  assassinado em 1890, com o de seu suposto descendente vivo mais próximo, o seu bisneto Ernie Lapoint.  Até este estudo, a relação familiar entre LaPointe e Touro Sentado era baseada em certidões de nascimento e óbito, uma árvore genealógica e uma revisão de registros históricos. Esta nova análise genética fornece uma linha adicional de evidência para reforçar seu parentesco. Um trabalho de genética forense comparou o DNA extraído de uma mecha de cabelo do líder indígena Touro Sentado , assassinado em 1890, com o de seu suposto descendente vivo mais próximo, o seu bisneto Ernie Lapoint . Graças a uma nova técnica de estudo do DNA foi possível confirmar pela primeira vez uma re...

Além da conhecida estrutura da dupla hélice, o DNA pode formar outras configurações muito mais incomuns, nas quais três ou até quatro fitas podem se associar. Pesquisadores espanhóis descreveram pela primeira vez a interface de união entre uma dupla hélice normal e uma forma exótica de DNA, o DNA-i. O DNA-i ou i-motif consiste em quatro fitas de DNA e é formado em regiões do genoma ricas em citosina. A descoberta de formas exóticas de DNA e suas uniões abre a possibilidade de desenvolver compostos antitumorais mais seletivos e com menos efeitos colaterais . O arranjo que a molécula de DNA normalmente adota é o da dupla hélice, também chamada de dupla hélice ou DNA-B , que consiste em duas fitas que se enrolam uma na outra como em uma escada em espiral. Esse modelo clássico da molécula de DNA é muito conhecido e foi descrito em 1953 pelos pesquisadores James Watson e Francis Crick . Aliás, todos os fatos e controvérsias relacionados com essa descoberta já contamos aqui . No entanto, o...

O recém-lançado site #GenomicNews é uma página  voltada para a divulgação científica de assuntos relacionados a DNA, genes, genomas, transcriptomas, microbiomas e outros temas correlatos. Com  matérias produzidas por profissionais da área de biologia celular e molecular de instituições consagradas como a Fiocruz e diversas universidades do Brasil e do mundo, o Genomic News pretende ser um canal direcionado a todos que buscam informações científicas atuais, confiáveis e de qualidade. Como não podia deixar de ser, as duas primeiras matérias do site esclarecem pontos importantes sobre a natureza da pandemia de Covid-19 provocada pelo novo coronavírus. No dia 19 de março de 2020 foi lançado o #GenomicNews , um site voltado para a divulgação científica sobre assuntos relacionados a DNA, genes, genomas, transcriptomas, microbiomas e outros temas correlatos. Com o mote "informação científica para todos", o #GenomicNews se propõe a ser uma fonte segura de informaçõe...

O custo com as tecnologias de sequenciamento de DNA vem caindo acentuadamente ao longo das duas últimas décadas e tem proporcionado estudos bem mais aprimorados de microbiomas, genômica e metagenômica. A velocidade de queda nos custos de sequenciamento tem sido bem mais rápida do que a preconizada pela famosa lei de Moore, adotada como parâmetros em  diversos setores da área de tecnologia. A   Lei de Moore é conhecida por  descrever uma tendência de longo prazo na indústria de hardware de computadores projetando a duplicação da 'potência computacional' a cada dois anos. Por muitos anos, o Instituto Nacional de Pesquisa do Genoma Humano ( NHGRI , na sigla em inglês) vem acompanhando os custos associados ao sequenciamento de DNA realizados nos centros de sequenciamento financiados pelo Instituto e tem constatado que essa tecnologia se tornou mais barata em um ritmo bem mais rápido que a lei de Moore ao longo dos anos 2010.  Os dados de contabilidade de cu...

Prestes a completar 30 anos do seu lançamento em 1990, o Projeto Genoma Humano (PGH) guarda fatos e curiosidades que ainda são desconhecidos do grande público. O projeto foi dirigido inicialmente por James Watson e consistiu num esforço internacional para o mapeamento do genoma humano e a identi ficação de todos os nucleótideos que o compõem. A possibilidade de lucro com o patenteamento de regiões do genoma humano atraiu o interesse do cientista e empresário em biotecno logia  Craig Venter, que fundou em 1998 a empresa privada Celera Genomics. A Celera se comprometeu em sequenciar todo o genoma humano até 2001, contra o final então previsto pelo consórcio público para 2003.  Com isso, iniciava-se uma rivalidade que serviu para alavancar o megaprojeto. Temendo um possível "loteamento" do genoma humano pela Celera, o PGH tomou por objetivo terminar seu trabalho antes da empresa  privada.   Prestes a completar 30 anos desde o seu lançamento em 1990, o Proje...

Um estudo publicado esta semana na revista  Science  concluiu que não há um gene homossexual, o que significa que a análise do DNA não pode levar a qualquer certeza sobre a preferência sexual de um ser humano.  Os resultados apresentados nesse estudo devem servir para enterrar de vez a busca por um  único gene  relacionado á homossexualidade em humanos, algo já desacreditado há tempos na comunidade científica. Além do mais, essa pesquisa abrangente inviabiliza as tentativas de usar informações extraídas do DNA para identificar pessoas com preferências homossexuais ou a utilização de métodos biológicos para reverter tais preferências, simplesmente pelo fato de que elas  dependem de fatores variados e complexos  demais para serem modificados. Um estudo publicado esta semana por pesquisadores das universidades de Harvard e Massachusetts Institute of Technology (MIT) na revista Science , concluiu que não há um gene homossexual, o que significa q...

Um vírus gigante ou megavírus é um vírus muito grande (alguns dos quais são maiores que as bactérias típicas), capaz de ser observado em um microscópio óptico comum. Esses vírus possuem genomas extremamente grandes em comparação com outros vírus e contêm muitos genes únicos não encontrados em outras formas de vida. No Brasil, já foram identificadas espécies novas de megavírus em diversas  coleções de água. A pesar do nome assustador, os vírus gigantes aparentemente não causam doenças no homem e infectam preferencialmente as amebas. Tão grandes que podem ser observados em um microscópio óptico comum, apesar do nome assustador, os vírus gigantes aparentemente não causam doenças no homem e infectam preferencialmente as amebas. De um modo geral, os vírus são historicamente definidos por duas características básicas: a estrutura biológica de genoma e o tamanho. Quanto á estrutura biológica do genoma, o vírus é composto por DNA ou RNA , são incapazes de auto divisão e possu...

Utilizando a mosca-das-frutas (Drosophila melanogaster) como modelo, pesquisadores europeus do Instituto de Biologia Evolutiva analisaram 300 elementos móveis de DNA capazes de contribuir para a resposta ao estresse, desenvolvimento embrionário e comportamento, fatores essenciais para a evolução das espécies. Em humanos, estima-se que mais de dois terços do genoma seja composto por elementos móveis. Geralmente, essas mutações são prejudiciais ao organismo ou não têm efeito. No entanto, algumas dessas variações são benéficas, causando uma vantagem evolutiva para alguns indivíduos, e acabam sendo perpetuadas nas populações. A diversidade biológica está intimamente relacionada às mutações genéticas dos organismos. Algumas dessas modificações são causadas pelos elementos móveis do DNA , fragmentos do genoma que podem se mover de um lugar para outro do material genético causando muitas alterações ou mutações. Em humanos, estima-se que mais de dois terços do genoma seja compos...

Mais de 20 representantes de comitês de ética europeus publicaram um documento de consenso expondo a necessidade de avaliar as implicações éticas, legais e sociais associadas às novas técnicas de edição genética como o CRISPR. O documento propõe a criação de um comitê europeu para avaliar os benefícios, limitações e possíveis riscos destas tecnologias tão promissoras, bem como assegurar o uso responsável destas técnicas. Outra função do comitê seria promover um debate social sobre o uso e aplicabilidade da edição genética Mais de 20 representantes de comitês de ética europeus publicaram na revista Transgenic Research um documento de consenso expondo a necessidade de avaliar as implicações éticas, legais e sociais associadas às novas técnicas de edição genética. O documento propõe a criação de um comitê europeu encarregado de avaliar os benefícios, limitações e possíveis riscos destas tecnologias tão promissoras, bem como assegurar o uso responsável destas técnicas. Out...

Uma equipe internacional formada por 31 pesquisadores de 11 países diferentes publicou na Nature um estudo que revela aspectos até então inédito da vida dos neandertais. A pesquisa revela que os neandertais foram capazes de se adaptar ao seu ambiente muito melhor do que se pensava e que dominavam o conhecimento sobre uma série de plantas e fungos medicinais e os usavam normalmente para curar doenças. Entre os fungos destaca-se o Penicillium , fonte de um antibiótico natural, a penicilina; entre as plantas medicinais usadas está a casca do álamo, que contém ácido salicílico, o princípio ativo do analgésico moderno conhecido como aspirina . Uma equipe internacional de 31 pesquisadores de onze países diferentes publicou recentemente na revista Nature um estudo que revela aspectos até então inédito da vida dos neandertais , a outra espécie inteligente de humanos, que desapareceu da Europa logo após a chegada dos primeiros seres humanos modernos, os nossos ancestrais diret...

Desenhista apaixonado por temas da ciência médica e biológica publica vídeos no Youtube com aulas explicadas por meio de esquemas ilustrativos confeccionados por ele no momento da explicação. Na aula em questão, Armando Hasundungan discorre sobre os mecanismos epigenéticos e a sua importância no desenvolvimento e crescimento celular e como eles são fundamentais na alteração de genes que levam à formação de tumores. Clique no vídeo para assistir ( com legendas em português) Mais uma daquelas aulas incríveis do Armando Hasundungan . Lembram dele? Aquele desenhista criativo que publica vídeos sobre os mais diversos temas da ciência médica e biológica . Nas suas aulas tudo é ilustrado por desenhos que ele mesmo faz no momento em que está explicando a matéria. Em seus vídeos publicados no Youtube , é possível aprender de maneira divertida, conteúdos sobre imunologia, fisiologia, cardiologia, nefrologia, sistema reprodutor , etc.  Desta vez, o tema selecionado é a metilaçã...

Equipe de pesquisadores do Reino Unido detectaram ondas sonoras imperceptíveis ​​ao ouvido humano no interior da molécula de DNA, as quais percorrem toda a sua estrutura. Em certos pontos, ocorre uma amplificação e alguns elos da dupla hélice são quebrados, abrindo um buraco para que as enzimas de transcrição e replicação possam entrar para executar seu trabalho. Pesquisadores da Universidade de Glasgow (Reino Unido) detectaram ondas sonoras imperceptíveis ​​ao ouvido humano no interior da molécula de DNA , as quais percorrem toda a sua estrutura. Em certos pontos, ocorre uma amplificação e alguns elos da dupla hélice são quebrados, abrindo um buraco para que as enzimas de transcrição e replicação possam entrar para executar seu trabalho. Os cientistas descobriram a existência de ondas sonoras que correm ao longo da cadeia de DNA, mas com uma frequência de poucos terahertz , ou seja, bilhões de vezes mais altas do que o ouvido humano ou um cachorro podem ouvir. Além disso...

Cientistas descobriram que apenas quatro fragmentos de RNA diferenciam humanos de macacos. Um novo estudo revelou que  grande parte da variação genética que existe entre os humanos e os grandes macacos, como chimpanzés, gorilas e bonobos, deve estar em outro tipo de material que não faz parte do nosso genoma: o RNA   Desde que todo o genoma humano foi sequenciado pela primeira vez há 13 anos , os cientistas ainda não tinham apresentado nenhuma grande novidade com relação à  nossa ancestralidade genômica . Na ocasião, ficaram chocados ao descobrirem que havia apenas 1,2% de diferença entre o DNA humano e o DNA de macacos . Agora, um novo estudo publicado na PLOS ONE revelou que grande parte dessa variação que existe entre os humanos e os grandes macacos, como chimpanzés, gorilas e bonobos, deve estar em outro tipo de material genético que não faz parte do nosso genoma: o RNA (ácido ribonucleico). A partir dessa pesquisa, uma equipe de pesquisadores do Instituto...