MinION: Um Sequenciador Que Cabe Na Palma da Mão
O minION é um dispositivo de sequenciamento portátil de DNA e RNA capaz de fornecer dados em tempo real a nível de gigabases. Com o MinION você pode sequenciar qualquer coisa em qualquer lugar. Ele cabe no bolso e pode ser recarregado por USB. O aparelho MinION Mk, com um peso de 100 gramas, é do tamanho de um grampeador, o que é minúsculo comparado a outros equipamentos sequenciadores que ocupam uma mesa inteira ou que são do tamanho de uma geladeira.
O minION é um poderoso dispositivo de sequenciamento portátil de DNA e RNA, desenvolvido pela Oxford Nanopore Technology (ONT), capaz de fornecer dados em tempo real a nível de gigabases. Com o MinION você pode sequenciar qualquer coisa em qualquer lugar. Ele cabe no bolso e pode ser recarregado por USB. O aparelho MinION Mk, com um peso de 100 gramas, é do tamanho de um grampeador, o que é minúsculo comparado a outros equipamentos sequenciadores que ocupam uma mesa inteira ou que são do tamanho de uma geladeira. Para que funcione, você simplesmente o conecta via porta USB 3.0 em um computador e tem acesso à informação do sequenciamento em tempo real.
O MinION pode ter importantes aplicações no estudo de genomas/ exomas inteiros, metagenômica, sequenciamento direcionado, transcriptoma (cDNA e cRNA direto), multiplex para amostras menores, etc.
O sequenciamento por nanoporos baseia-se na leitura de uma molécula de DNA conforme esta atravessa o nanoporo. Mais especificamente, o sequenciador é composto por flow cells, onde há uma membrana contendo milhares de poros. Após a preparação das bibliotecas, é aplicado uma diferença de potencial entre os dois lados da membrana gerando uma corrente iônica que passa pelos poros e é medida por sensores do aparelho. Essa corrente é alterada quando uma molécula de DNA atravessa o poro, e cada nucleotídeo (A, C, T ou G) muda a corrente com uma intensidade diferente, sendo teoricamente possível identificar todas as bases de uma molécula inteira.
O MinION tem revolucionado o campo de sequenciamento de DNA e RNA pela sua portabilidade e capacidade de geração de longas sequências (cada flow cell pode gerar de 10 a 30 Gb de dados de sequência de DNA/RNA), além disso, o MinION gera dados em tempo real, permitindo que a análise seja realizada durante o experimento ( veja o vídeo).
O custo do MinION também é muito menor (cerca de mil dólares) o que é um valor baixo para um sequenciador. O tamanho dos reads pode chegar a uma média de 2kb dependendo do organismo, o que é um grande salto, comparado aos pequenos reads provenientes da tecnologia Illumina, em que são normalmente menores que 300bp. O Nanopore consegue também detectar alterações epigenéticas, como metilações no DNA.
Para saber mais, clique nos links acima.
Comentários
Postar um comentário