STAMP: Analisando Milhões de Células Sem Sequenciamento

Pesquisadores do Centro Nacional de Análise Genômica (CNAG, Espanha) e seus colaboradores desenvolveram uma técnica permite que milhões de células individuais sejam analisadas sem a necessidade de sequenciá-las. Chamada de STAMP, a nova técnica em vez de isolar células em microgotas, fixa e permeabiliza células em suspensão, ancora-as em lâminas compatíveis com imagens e as organiza em monocamadas uniformes, semelhantes a cortes de tecido (foto). Isso permite a análise com plataformas avançadas de microscopia, que fornecem dados detalhados sobre tamanho, forma e heterogeneidade molecular.

Pesquisadores do Centro Nacional de Análise Genômica (CNAG, Espanha), juntamente com o St. Jude Children's Research Hospital (EUA) e a Universidade de Adelaide (Austrália), desenvolveram uma técnica que transforma completamente a análise de células individuais. Chamada de STAMP (Single-Cell Transcriptomics Analysis and Multimodal Profiling through Imaging), a nova técnica permite capturar imagens de alta resolução de células em suspensão a partir de amostras líquidas, sem a necessidade de sequenciamento.

Segundo os pesquisadores, o STAMP oferece três grandes inovações. Ele permite o estudo de células individuais de uma ampla variedade de fontes — de biópsias líquidas a células-tronco embrionárias — tanto na íntegra quanto a partir de seus núcleos. Além disso, facilita a análise simultânea do transcriptoma (os genes que estão ativos) e do proteoma (as proteínas que definem a função celular). Por fim, tudo isso é obtido por meio de imagens, graças às plataformas de genômica espacial de última geração, que também fornecem informações sobre a morfologia celular.

A chave para o STAMP está na preparação da amostra . Em vez de isolar células em microgotas, a técnica fixa e permeabiliza células em suspensão, ancora-as em lâminas compatíveis com imagens e as organiza em monocamadas uniformes, semelhantes a cortes de tecido. Isso permite a análise com plataformas como CosMx (Nanostring) e Xenium (10X Genomics), que fornecem dados detalhados sobre tamanho, forma e heterogeneidade molecular. O STAMP integra informações espaciais, moleculares e morfológicas em um único experimento.

Além de seu poder analítico, o STAMP se destaca por sua acessibilidade. Ele reduz os custos e o tempo de análise e permite a identificação de populações celulares extremamente raras, como células tumorais circulantes (CTCs), essenciais para a compreensão da metástase. Também abre caminho para estudos em larga escala com edição genética, ensaios de medicamentos em modelos celulares e análises detalhadas do sistema imunológico.

Fonte: Agência SINC